新工具允许研究人员比较基于不同地图集构建的大脑连接图
2023-07-07 10:00:43
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(资料图片)
绘制大脑不同区域之间连接的能力帮助科学家更好地了解大脑与行为的关系、人与人之间的大脑有何不同，以及他们如何受到疾病的影响。这些图被称为连接组，由叠加在图册上的成像数据组成，这些图册定义了不同大脑区域的位置和边界。但大脑图谱有许多不同版本，建立在一个版本上的连接组不能直接与建立在另一个版本上的连接组进行比较。
在一项新研究中，耶鲁大学的研究人员开发了一种公开可用的工具，可以进行这些比较。这种新方法被称为通过最佳传输进行跨图谱重映射(CAROT)，可以将建立在一个图谱上的连接组转变为基于另一个图谱的连接组，使研究人员能够比较来自不同研究的连接组，并在未来的分析中重复使用它们。6 月 8 日的《医学图像分析》杂志描述了这一发现。
大脑图谱将大脑划分为不同的区域，但它们的划分方式并不相同，区域的大小、形状和数量各不相同。这限制了连接组的使用，博士贾维德·达达什卡里米 (Javid Dadashkarimi) 说。耶鲁大学工程与应用科学学院计算机科学系的候选人，也是该研究的主要作者。
“以前，唯一的解决方案是使用不同的图集重新处理原始数据，这需要时间，并且需要访问并不总是可用的原始数据，”在耶鲁大学医学院达斯汀·沙伊诺斯特的两个实验室进行这项研究的达达什卡里米说。和阿明·卡巴西(Amin Karbasi)在工程与应用科学学院。
借助 CAROT，科学家可以采用从一个图谱构建的连接组，并将其重新配置以符合另一个图谱，而无需重新处理数据。它使用一种称为最佳传输的数学方法来实现这一点。
